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基礎醫(yī)學網(wǎng)絡信息資源整合及應用論文
基礎醫(yī)學在醫(yī)藥衛(wèi)生領域起著舉足輕重的作用。多年以來，我國基礎醫(yī)學研宄在疑難病癥的病因、病理、病程發(fā)展等方面取得了卓有成效的成果⑴�；A醫(yī)學研宄離不開信息資源的支持。目前網(wǎng)絡中積累的基礎醫(yī)學資源主要包括人體生理心理相關數(shù)據(jù)、基因序列、蛋白質圖譜、可視人體圖像等。歐美一些發(fā)達國家醫(yī)學信息網(wǎng)絡化建設起步較早，資源的網(wǎng)絡化服務也比較成熟。像歐洲的EMBL、美國的NCBI、日本的DDBJ都建立了多個大型的基因數(shù)據(jù)庫和蛋白質結構數(shù)據(jù)庫，實現(xiàn)數(shù)據(jù)的同步交換和更新，成為基礎醫(yī)學研宄必需的資源獲取平臺。我國基礎醫(yī)學資源較為分散，主要存儲在不同的科研單位，多以小型專業(yè)數(shù)據(jù)庫的形式為用戶提供服務，有各自的訪問路徑和查詢接口，服務方式和資源類型都較為單一。如何在這些來源廣泛、類型不同的資源之間建立聯(lián)系，滿足用戶全面的資源獲取需求，提高資源的利用率和共享率，是我國基礎醫(yī)學研宄必須面對的一大問題[2]。目前，解決這一問題的方法是實現(xiàn)基礎醫(yī)學資源整合。
1資源整合的意義
1。1為科研工作提供便利
科研水平的進步和科研內容的豐富使基礎醫(yī)學研宄過程中對科學數(shù)據(jù)資源的需求不斷提高[4]。基礎醫(yī)學的研宄是多個學科的交叉和融合。通過整合基礎醫(yī)學資源，科研人員可以通過一次檢索獲取多個學科的相關信息，提高了他們的信息資源
�、僦袊t(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所，北京協(xié)和醫(yī)學院流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學系
�、谥袊t(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所，北京協(xié)和醫(yī)學院網(wǎng)絡中心
�、壑袊t(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所，北京協(xié)和醫(yī)學院基礎學院病原生物學系分子寄生蟲實驗室北京100005*基金項目：科技部國家科技基礎條件平臺科學數(shù)據(jù)共享工程重大項目。
獲取能力�；A醫(yī)學資源整合提高了現(xiàn)有數(shù)據(jù)資源的利用率，避免了科研的重復投資1。2為政府決策提供支持基礎醫(yī)學資源整合可以讓有關部門對我國基礎醫(yī)學科研現(xiàn)狀整體把握，能夠更為科學地判斷基礎醫(yī)學研宄熱點，實現(xiàn)科研資金的合理分配，提高科研效率。通過對整合資源的系統(tǒng)分析，能夠提高數(shù)據(jù)分析的質量[5]，為我國政府衛(wèi)生管理政策的制定
和衛(wèi)生決策的實施提供更為有力的支持。
1。3加強基礎醫(yī)學資源管理
目前基礎醫(yī)學數(shù)據(jù)資源呈現(xiàn)電子化、網(wǎng)絡化、分布性、無序性等特點這給資源有效管理和合理調配帶來很大困難。通過資源整合可以有效地實現(xiàn)數(shù)據(jù)資源的統(tǒng)一管理，實現(xiàn)科研成就的傳承和利用。
2基礎醫(yī)學資源整合建設
近年來，我國政府極為重視科學數(shù)據(jù)共享，己經(jīng)將其作為一項戰(zhàn)略選擇納入國家科技基礎條件平臺建設�；A醫(yī)學科學數(shù)據(jù)共享網(wǎng)（http//www。bmicc。cn，以下簡稱“共享網(wǎng)”）作為國家科技基礎條件平臺建設下醫(yī)藥衛(wèi)生共享項目的子項目，其主要目的就是實現(xiàn)我國網(wǎng)絡環(huán)境下的基礎醫(yī)學資源整合。通過過去幾年的不斷建設，共享網(wǎng)取得長足的進步和廣泛的影響，使我國基礎醫(yī)學領域的資源整合取得了較為可觀的成效。
2。1資源整合的實現(xiàn)
2。1。1資源來源：共享網(wǎng)自2004年正式投入建設并對外公開發(fā)布以來，本著“邊建設，邊服務”的原則，得到全國范圍內多家科研單位和高等院校的支持和響應。目前共享網(wǎng)共整合了來自清華大學、北京大學、中科院生物物理所、北京華大基因、中國醫(yī)學科學院、軍事醫(yī)學科學院等10多家單位的25個數(shù)據(jù)庫資源^根據(jù)數(shù)據(jù)內容的不同，共享網(wǎng)將整合的25個數(shù)據(jù)庫分為以下4類：1）人群調查及人體數(shù)據(jù)資源包括中國人生理常數(shù)數(shù)據(jù)庫、中國人心理狀況數(shù)據(jù)庫、中國數(shù)字化可視人體數(shù)據(jù)庫、中國人群亞健康現(xiàn)狀調查數(shù)據(jù)庫及中國婦女和兒童營養(yǎng)狀況數(shù)據(jù)庫、中國人群心血管健康研宄數(shù)據(jù)庫共6個^（2）分子機制類數(shù)據(jù)資源包括非編碼RNA數(shù)據(jù)庫、神經(jīng)突觸數(shù)據(jù)庫、人類腫瘤相關抗原數(shù)據(jù)庫、人類肝臟蛋白質組表達譜數(shù)據(jù)庫、人類尿蛋白質數(shù)據(jù)庫等共13個數(shù)據(jù)庫。（3）模式生物類數(shù)據(jù)資源包括動物模型基因組數(shù)據(jù)庫、基因組多態(tài)性圖譜數(shù)據(jù)庫、模式生物基因組數(shù)據(jù)庫和轉錄因子數(shù)據(jù)庫4個^（4）實驗材料數(shù)據(jù)資源包括實驗細胞數(shù)據(jù)庫和遺傳工程小鼠品系基本表型數(shù)據(jù)庫。
2。1。2整合技術：共享網(wǎng)采用門戶技術（Portal）來實現(xiàn)資源整合。門戶是一個應用框架，它能將各種應用系統(tǒng)、數(shù)據(jù)資源集成到一個信息管理平臺上，并以統(tǒng)一的用戶界面提供服務。利用門戶中的內容管理系統(tǒng)（contentmanagementsystem，CMS）將各個數(shù)據(jù)庫整合到共享平臺中，為用戶提供一站式的資源瀏覽和檢索系統(tǒng)，避免了信息冗余和查詢重復，提高信息獲取效率。共享網(wǎng)對整合的數(shù)據(jù)資源采用Oracle數(shù)據(jù)庫進行管理，并用WindowsServer2003服務器對外提供服務。
2。2資源整合管理
資源整合的關鍵是把好數(shù)據(jù)質量關。為保證資源質量，共享網(wǎng)成立了專門的學術委員會，聘請國內基礎醫(yī)學領域的院士、專家擔任委員會成員，對申請加入共享網(wǎng)的數(shù)據(jù)資源從數(shù)據(jù)量、數(shù)據(jù)服務、數(shù)據(jù)質量、科研成果等多個方面嚴格審查，確保每個整合資源的科學性和實用性。
根據(jù)基礎醫(yī)學數(shù)據(jù)量大，數(shù)據(jù)類型多樣的特點，共享網(wǎng)對整合的數(shù)據(jù)資源采用元數(shù)據(jù)方式統(tǒng)一管理。元數(shù)據(jù)（metadata）是關于數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)，是描述、定位、檢索、利用、管理信息資源的結構化信息。利用元數(shù)據(jù)對基礎醫(yī)學信息資源進行開發(fā)和描述，統(tǒng)一定義各種數(shù)據(jù)資源的基本信息和功能，為用戶使用提供方便。
3資源整合中的問題及對策
3。1資源整合中存在的問題
3。1。1數(shù)據(jù)標準不統(tǒng)一：由于基礎醫(yī)學資源類型多樣，數(shù)據(jù)編碼和組織方式都差別較大，數(shù)據(jù)管理沒有統(tǒng)一的標準，為資源整合帶來了很大的麻煩。
3。1。2資源管理不規(guī)范：有些基礎醫(yī)學資源涉及到保密性或安全性等問題，沒有完善的管理辦法對其進行合理規(guī)劃，并且資源整合還面臨資源所有權、知識產(chǎn)權及個人隱私等問題，給資源整合帶來不便。
3。1。3多數(shù)單位配合積極性不高：目前我國科學數(shù)據(jù)共享相關政策和法律法規(guī)尚不完善，缺乏相應的補償機制和激勵機制，致使共享積極性不高，共享觀念淡薄。一些數(shù)據(jù)資源被視為個人或單位所有，使得長期積累的數(shù)據(jù)資源無法實現(xiàn)更高的科學價值。
3。1。4數(shù)據(jù)分類和編碼紊亂：基礎醫(yī)學研宄己經(jīng)積累了大量的科學數(shù)據(jù)，但是這些科學數(shù)據(jù)資源缺乏系統(tǒng)化的歸納、層次化的標識和規(guī)范化的表達，缺乏統(tǒng)一的、可操作的資源調查、規(guī)劃、設計與描述，導致科學數(shù)據(jù)資源使用效率低。數(shù)據(jù)格式的不同導致描述和管理的差異，給資源整合帶來困難。
3。1。5復合型人才匱乏：基礎醫(yī)學資源整合需要具備掌握基礎醫(yī)學知識、軟件開發(fā)技術和資源管理方法的復合型人才。而目前從事資源整合工作的人員大多只具備單一領域的知識背景，難以實現(xiàn)明確的需求分析和充分的知識交流。
34解決方案
3。2。1做好資源規(guī)劃工作：為了促進共享網(wǎng)資源整合有計劃、
可持續(xù)發(fā)展，必須要加強領導和管理，統(tǒng)籌規(guī)劃基礎醫(yī)學各類資源的實質性整合，加速從信息孤島向實現(xiàn)信息高度共享和網(wǎng)絡互聯(lián)的模式轉換[8]。同時對網(wǎng)絡中基礎醫(yī)學資源進行追蹤考察，全程管理，確�；A醫(yī)學資源整合的遠期效果[1]。
3。22制定標準和規(guī)范：標準化是實現(xiàn)資源共享的根本要求。沒有統(tǒng)一的標準，就不能實現(xiàn)真正意義上的資源共享[9]。在基礎醫(yī)學資源整合的同時，要從我國國情出發(fā)，建立一套符合我國資源現(xiàn)狀的、能夠與國際接軌的標準規(guī)范，指導共享網(wǎng)建設科學高效進行。
3。23制定相應的法規(guī)政策：根據(jù)我國資源整合面臨的實際困難，國家有關部門應該建立健全資源整合的法律法規(guī)，明確規(guī)定科學數(shù)據(jù)共享原則，界定數(shù)據(jù)共享范圍。同時建立相應的補償機制，出臺督促賞罰措施。只有這樣才能使科學數(shù)據(jù)共享有法可依，促進科學數(shù)據(jù)管理和共享，使其潛在的價值得以充分發(fā)揮[5]。
3。24做好數(shù)據(jù)分類和編碼：實現(xiàn)基礎醫(yī)學資源整合要加強數(shù)據(jù)分類的研宄，提高醫(yī)藥衛(wèi)生數(shù)據(jù)資源的管理和共享程度[7]。
3。25培養(yǎng)多學科交叉的復合型人才：人才建設是保證資源整合建設長期發(fā)展的前提。因此在資源整合的過程中應該針對基礎醫(yī)學的專業(yè)性需求，培養(yǎng)一批優(yōu)秀的跨學科人才，保證資源整合的技術創(chuàng)新性和服務全面性。
4小結
基礎醫(yī)學科學數(shù)據(jù)作為一種科研資源其價值只有廣泛傳播和使用才能更大程度地發(fā)揮。通過建立共享網(wǎng)實現(xiàn)資源的實質性優(yōu)化整合和廣泛性互補共享[8]，為廣大的基礎醫(yī)學工作者提供方便的信息獲取渠道，以科學的理念、合理的機制，使整合資源達到更高層次的完美結合[1]。共享網(wǎng)建設本著“物理上合理分布、層次分明，邏輯上高度統(tǒng)一、充分共享”的建設宗旨，力爭建立一個提供“健康一亞健康一疾病”的一體化健康信息服務，為健康管理、疾病預防、藥品研發(fā)和臨床診治提供全面支持的綜合性基礎醫(yī)學資源平臺。
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